MySQL → Пакетное обновление или batch update

Иногда возникает потребность обновить много записей в базе данных, например 3000, 7000 или 25000 штук. Видел даже веб-формы с таким количеством полей, хоть это и полное безумие :) Можно, конечно, обновить эти записи поштучно, но бомбардировать сервер базы данных запросами - плохая идея. Желательно сделать это за раз. И сделать это возможно следующим образом:

1
2
3

INSERT INTO table (`id`, `x`, `y`) VALUES
  (1, 2, 3), (4, 5, 6), (7, 8, 9)
  ON DUPLICATE KEY UPDATE `x` = VALUES(`x`), `y` = VALUES(`y`);

P.S.: Однако, как подсказывают в комментариях, есть нюанс. В случае этого самого ON DUPLICATE KEY UPDATE автоинкрементное поле для таблиц InnoDB всё равно увеличится, будто была вставка в таблицу.